Житель маленького городка пастор Томас механически выполняет свои обязанности перед редеющей паствой, включая свою непоколебимо преданную возлюбленную Марту. Когда его просят успокоить обеспокоенного прихожанина, опасающегося ядерного уничтожения, Томас с ужасом обнаруживает, что не может высказать ничего, кроме терзающих его самого сомнений.
Вышедшие друг за другом «Сквозь тёмное стекло», «Причастие» и «Молчание» многие кинокритики объединили в «трилогию веры», хоть сам режиссёр и возражал против такой трактовки. Впрочем, в мире Бергмана бог и впрямь очень важен, важен именно тем, что его нет (или - что ещё хуже - он глух к человеческим страданиям) - пустота на его месте мучительно зияет, зритель разделяет с героями ужас богооставленности.